BioCandidateRanker:一个酶动力学预测的诚实败局

一个多模态酶候选排序系统的完整负面结果报告。536K 参数的蛋白-分子图联合模型,在同源冷切分上被 Morgan 指纹 MLP 追平;外部基准 EnzEngDB 排序 Spearman≈0;IMDH 突变景观两个方法均不如随机。

DisorderFlow:为"无形的敌人"设计抗体

一个用贝叶斯流网络(BFN)为天然无序蛋白(IDP)设计抗体的全栈平台。V6 模型在 2032 个蛋白上实现 ipTM r=0.950;从 Aβ42 到 AQP4 膜蛋白,挑战结构生物学无法触及的靶点;25 条 scFv 候选进入湿实验验证路线图。

CASP17 参赛记:用置信度预测重新审视蛋白设计

参加 CASP17 竞赛评估的记录。以贝叶斯流网络(BFN)的内置置信度头对标 AlphaFold2,在固定骨架序列设计与内禀无序蛋白预测两条线上,探索"模型自评"的边界。

Yeast-MetaTwin:给酵母代谢模型装上"地下管网"

从 Yeast-MetaTwin 预印本出发,记录我自己的整合部署工作:7512 反应审计、反应证据模型(F1=0.954)、10H2DA 蜂王浆脂肪酸靶点 FBA 验证与工程候选矩阵。