在生物的无性之美与有性之美间,以代码丈量生命。https://example.com/zh-cnhttps://example.com/blog/arginine-co2-recycle.md/https://example.com/blog/arginine-co2-recycle.md/一个把发酵副产物 CO₂ 原位转化为底物的合成生物学设想:以大肠杆菌为底盘,重构 L-精氨酸合成途径,同时引入碳固定模块,让菌体"自产自销"碳排放。Mon, 06 Jul 2026 00:00:00 GMT合成生物学合成生物学大肠杆菌L-精氨酸碳固定代谢工程设想https://example.com/blog/disorderflow-idp-antibody.md/https://example.com/blog/disorderflow-idp-antibody.md/一个用贝叶斯流网络(BFN)为天然无序蛋白(IDP)设计抗体的全栈平台。从阿尔茨海默病的 Aβ42 到帕金森的 α-突触核蛋白,挑战传统结构生物学无法触及的"无形靶点"。Sun, 05 Jul 2026 00:00:00 GMT计算生物学IDP抗体设计BFN深度学习阿尔茨海默病AlphaFold2https://example.com/blog/casp17-confidence.md/https://example.com/blog/casp17-confidence.md/参加 CASP17 竞赛评估的记录。以贝叶斯流网络(BFN)的内置置信度头对标 AlphaFold2,在固定骨架序列设计与内禀无序蛋白预测两条线上,探索"模型自评"的边界。Sat, 04 Jul 2026 00:00:00 GMT计算生物学CASP蛋白质设计置信度预测BFNCAID竞赛https://example.com/blog/science-agent.md/https://example.com/blog/science-agent.md/一个基于 Qwen 多智能体集群的科研闭环系统。从"什么导致阿尔茨海默病"出发,自动完成假设生成、文献核验、数据分析、图像理解、同行评审,三轮迭代后假设评分从 6.58 升至 8.33。Fri, 03 Jul 2026 00:00:00 GMTAI × 生命科学AI智能体Qwen阿尔茨海默病科研自动化多智能体https://example.com/blog/bacterial-game.md/https://example.com/blog/bacterial-game.md/参加合成生物学创新赛细菌博弈赛道的记录。以大肠杆菌 MG1655 为底盘,敲除 acrA 制造"可控弱点",用 gadE 组成型表达补强酸抗,再以 UV 适应性进化优化三维博弈。Thu, 02 Jul 2026 00:00:00 GMT合成生物学合成生物学大肠杆菌博弈论适应性进化代谢工程竞赛https://example.com/blog/yeast-metatwin.md/https://example.com/blog/yeast-metatwin.md/一个结合逆生物合成与深度学习的酵母基因组级代谢模型构建工作流。通过挖掘"地下代谢网络"(underground metabolism),Yeast-MetaTwin 覆盖了酵母 84% 的代谢酶和 92% 的代谢物组。Wed, 01 Jul 2026 00:00:00 GMT计算生物学酵母代谢模型深度学习逆生物合成FBA基因组规模https://example.com/blog/welcome.md/https://example.com/blog/welcome.md/一个生物与计算机交叉从业者,在博客开篇谈谈为何要把"无性之美"与"有性之美"作为这里的哲学锚点。Sun, 01 Dec 2024 00:00:00 GMT随笔公告哲学生物随笔